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/ Die Ultimative Software-P…i Collection 1996 & 1997 / Die Ultimative Software-Pakete CD-ROM fur Atari Collection 1996 & 1997.iso / w / wissensc / osmochem / topomatr.txt < prev   
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Text File  |  1996-09-18  |  3.9 KB  |  125 lines
  1.  
  2.   
  3.                                                         OSMOCHEM.PRG
  4.   
  5.                         T o p o l o g i s c h e 
  6.  
  7.                             M a t r i z e n
  8.  
  9.  
  10.    Um einer Verbindung einen Geruchseindruck zuordnen zu koennen,
  11.  
  12.    muessen ihre Strukturparameter eingegeben werden.
  13.  
  14.    Neben Informationen ueber Art der funktionellen Gruppe und der
  15.  
  16.    Groesse der Verbindung, spielt die Struktur des Duftstoffs die
  17.  
  18.    entscheidende Rolle bei der Geruchsbestimmung. Sie wird in Form 
  19.  
  20.    der topologischen Matrix des Molekuels eingegeben. Dazu werden die
  21.  
  22.    Kohlen- und Sauerstoffatome entsprechend folgender fuer die 
  23.  
  24.    Orientierung des Riechstoffs am Rezeptor wichtigen "Regeln"
  25.  
  26.    numeriert:
  27.  
  28.     
  29.    --------------------------------------------------------------------
  30.  
  31.     o An der (polarsten) osmophoren Gruppe oder (in linearen Verbin-
  32.  
  33.       dungen) dem kuerzesten aliphatischen Rest beginnen!
  34.  
  35.     o In Richtung der naechst polaren Gruppe oder (beim Fehlen weite-
  36.  
  37.       rer funktioneller Gruppen) der naechsten Verzweigung fortfahren!
  38.  
  39.     o Aliphatische Verzweigungen immer erst vollstaendig durchlaufen!
  40.  
  41.     o Auf volumenbestimmenden Molekuelteilen bewegen, 'innere Bruecken'
  42.  
  43.       stets vernachlaessigen!
  44.  
  45.    --------------------------------------------------------------------
  46.  
  47.     
  48.    Entsprechend der Reihenfolge der Numerierung fragt der Computer
  49.  
  50.    Zeile fuer Zeile der Matrix mit der Hauptdiagonale beginnend ab.
  51.  
  52.    In die Hauptdiagonale (also jeweils als erstes Zeichen der Ein-
  53.  
  54.    gabezeile) wird als Parameter das Elementsymbol des Atoms ( 'c'
  55.  
  56.    fuer Kohlenstoff und 'o' fuer Sauerstoff) eingegeben. Dann erhalten
  57.  
  58.    jeweils die Spalten (Nummern der betreffenden Atome) in der Ein-
  59.  
  60.    gabezeile den Wert '1', mit dem das Atom in Verbindung steht,
  61.  
  62.    alle uebrigen den Wert '0'.
  63.  
  64.    Zur Auswertung spiegelt der Computer die Elemente der Matrix an
  65.  
  66.    ihrer Hauptdiagonalen und ordnet den Strukturmerkmalen Duft-
  67.  
  68.    elemente zu. Wird die Eingabe der Matrizenzeile vor Ende der
  69.  
  70.    Zeile abgebrochen wird die Zeile mit Nullen "aufgefuellt". Ist
  71.  
  72.    das letzte eingegebene Zeichen eine '2' (sekundaere) oder '3'
  73.  
  74.    (tertiaere Methylierung) wird zuvor eine entsprechende Anzahl 
  75.  
  76.    von Einsen gesetzt. Als weitere Vereinfachungen koennen fuer 'c'
  77.  
  78.    '0' und 'C'  und  fuer 'o'  '.', 'O' und '+' eingegeben werden.
  79.  
  80.    Eine Korrektur der letzten Eingabezeile ist mit '*' und eine 
  81.  
  82.    Neueingabe der topologischen Matrix  mit '-' moeglich.  
  83.  
  84.    
  85.                          T a s t e n f e l d
  86.  
  87.       
  88.           I---I---I---I---I       
  89.           I   I   I   I * I       * = ZEILENKORREKTUR
  90.           I---I---I---I---I
  91.           I   I   I   I - I       - = NEUEINGABE DER MATRIX
  92.           I---I---I---I---I
  93.           I   I   I   I + I       + = SAUERSTOFFATOM
  94.           I---I---I---I---I
  95.           I 1 I 2 I 3 I E I       1 = BINDUNG    0 = NICHTBINDUNG
  96.           I-------I---I N I       2 = SEK.           U. C-ATOM
  97.           I 0     I . I T I       3 = TERT. CH   . = SAUERSTOFF
  98.           I-------I---I---I                   3
  99.       
  100.  
  101.  
  102.    Die Eingabe der topologischen Matrix     
  103.                                                   123456789
  104.    erscheint auf den ersten Blick etwas          
  105.                                                 1 .1
  106.    umstaendlich, aber mit etwas Uebung ist      2  01
  107.                                                 3   01
  108.    sie schneller und einfacher als etwa         4    010001
  109.                                                 5     01
  110.    eine Zeichnung der Verbindung mit der        6      01
  111.                                                 7       01
  112.    Maus oder eine spezielle Nomenklatur.        8        01
  113.                                                 9
  114.    Zum Beispiel: Phenylethylalkohol
  115.  
  116.  
  117.  
  118.    Viel Erfolg mit OSMOCHEM.PRG wuenscht Ihnen
  119.  
  120.                    Philip Kraft
  121.  
  122.  
  123.  
  124.         
  125.